Nella navata di destra sono collocate tre cappelle: Cappella di Sant’Agostino: sul'altare, il Santo in atto di scrivere (sec. XVII). Cappella dei Santissimi Stefano e Lorenzo: sul'altare i due Santi, rilievo marmoreo quattrocentesco scuola di Andrea Bregno (XV secolo) e Testa marmorea di Cristo, copia secentesca da Michelangelo (sec. XVI). Cappella di S. Emerenziana, restaurata da Andrea Busiri Vici (1818-1911): sull'altare e ai lati, tele con Fatti della vita della Santa, opera di Eugenio Cisterna (1862–1933).