All'estremità del braccio destro del transetto si trova l’altare dell'Incoronazione di Maria, l’opera è una traduzione in mosaico di una celebre tela, eseguita da Giulio Pippi, detto Giulio Romano (1499–1546) su disegno del suo maestro Raffaello Sanzio (1483–1520), l’originale è custodito nella pinacoteca dei Musei Vaticani. L'altare presenta una preziosa mensa ornata da due caratteristiche pietre ornamentali la malachite dal colore verde smeraldo e riquadri di lapislazzuli dal colore blu intenso. A fianco della cappella due statue a destra Santa Scolastica opera di Felice Baini e a sinistra San Benedetto opera di Filippo Gnaccarini (1804-1875).