Altare maggiore é cattedra episcopale. L'abside è decorato da pitture e stucchi e da notevoli affreschi di Giovanni Mannozzi, detto Giovanni da San Giovanni (1630 circa): essi raffigurano nel registro superiore storie dei Ss. Quattro Coronati, in quello inferiore storia dei martiri di Pannonia, e in alto, in un tripudio di colori, fra le nuvole e i vaghi cieli tipici della pittura barocca,la Gloria di Tutti i Santi. In questo affresco una bizzarra idea dell'autore gli fece dipingere gli Angeli con chiari attributi femminili, cosi che il dipinto era un tempo chiamato “il Coro delle Angiolesse”.