L'altare, speculare a quello di San Luigi, fu eseguito nel 1749 dallo scalpellino Francesco Cerroti, dopo il rifiuto del progetto presentato da Luigi Vanvitelli. L'urna che costituisce le reliquie di San Giovanni Berchmans ripropone il medesimo impianto decorativo presente in quella di San Luigi. Essa è opera degli scultori F. Viti e V. Bruno e fu realizzata nel 1873 su disegno di Virginio Vespignani. Anche negli affreschi della volta ritorna lo schema presente sul braccio opposto del transetto.

• Altare: Filippo della Valle, pala marmorea dell’Annunciazione (1750) figure allegoriche (Castità e Umiltà) e angeli dì Pietro Bracci (1649)
  
• Sulla volta, Assunzione del Pozzo; ai lati del finestrone, affreschi di Ludovico Mazzanti.

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