A sinistra dell’altare maggiore si trova la cappella di Santa Severa con volta a crociera ribassata, costruito dalle Clarisse nel 1685 con elementi dismessi del monumento funebre del cardinale Lorenzo Cybo, provenienti dalla chiesa di S. Maria del Popolo, donati dal cardinale Alderano Cybo alle Clarisse di S. Cosimato. Nella parete di destra della cappella è esposta la grata dietro la quale le suore di clausura seguivano le celebrazioni religiose, senza essere viste; accanto è esposta la lapide di consacrazione della chiesa effettuata da papa Alessandro II (1015-1073) nel 1069.